大元帥府前身為始建于清光緒33年（1907年）的廣東士敏土（cement）廠，也就是廣東水泥廠。廣東水泥廠是當(dāng)時我國第二大水泥廠，其生產(chǎn)規(guī)模僅次于天津開平水泥廠。1917年7月，孫中山來到廣州，建立中華民國軍政府，任海陸軍大元帥，開展護法運動的時候，征用這里作為大元帥府；1923年2月，孫中山重返廣州進行革命活動，同樣也在這里建立陸海軍大元帥大本營。孫中山逝世后，這里曾作為國父文化教育館兩廣分館、國父紀(jì)念館等。廣州解放后，該處先后成為部隊和省有關(guān)部門的辦公用房，在1964年后成為廣東省農(nóng)業(yè)機械供應(yīng)公司辦公和居住用房。1998年10月，大元帥府的舊址被移交給廣州市文物管理部門，籌建孫中山大元帥府紀(jì)念館。